在神秘莫测的乌蒙灵谷一个山洞内，封印着拥有强大力量的上古凶剑“焚寂”，传说这把剑足以令持有者杀戒大开。在“焚寂”的封印即将解除之际，一群黑衣人闯入灵谷，残忍剿灭了守护凶剑韩氏一族。韩氏子嗣韩云溪（李易峰 饰）被紫胤真人所救，带回天墉城。失去记忆的云溪更名为百里屠苏，跟随真人学习剑术。时光荏苒，转眼八年过去，新仇旧怨以及体内蓄势待发的煞气让屠苏无法找到容身之地，万般无奈之下他只得选择下山。 险恶江湖，逐渐找回记忆的屠苏四处寻找灭族仇人，在这一过程中他与欧阳少恭（乔振宇 饰）、风晴雪（杨幂 饰）等人邂逅。由此上演了一连串惊天动地的剑侠传奇……
故事开篇，讲诉焚祭剑出身由来，因其由万千煞气铸成，女娲恐它为祸世间，将它封印于乌蒙灵谷冰炎洞内，交由一方部落看守。因女娲封印期限将至，守护者休宁担忧封印镇不住焚寂，与幽都婆婆报告如果使者再不来，自己打算向紫胤真人求助，幽都婆婆制止她，表示会派巫贤风广陌前来相助。这时洞口一黑影出现，休宁运功打过去，却发现是自己的儿子云溪，云溪马上认错跑出去。跑到结界边，云溪发现一只会说话的狐狸，追过去发现有个洞可以出去。虽记得娘亲叮嘱自己不可以出村子的结界，但云溪还是追着狐狸爬出了洞去。狐狸见云溪追来，赶紧跑去找一颗老树求救，见老树没反应又赶紧逃跑，云溪紧追不舍。幽都内，风广陌要外出办事，临走前送给妹妹灵石手链，没么舍不得他出去闯荡，哥哥安慰她可以用手链感应自己，对于能出去见识外面世界哥哥感到十分激动，并承诺等办完事情就带苗苗出去见识一下。妹妹嘟嘟嘴，觉得婆婆不会让自己出去。云溪追到狐狸，抱起它在怀里，回头却发现一只大熊在身后，云溪赶紧抱着狐狸逃命。大熊弄断大树，砸伤了云溪，云溪让狐狸快逃命，狐狸飞上去与大熊厮打，大熊将它打到一边。危急关头，一白衣少年出现，三两下打跑大熊。风广陌来见休宁，休宁追问他为何迟到三日，一时气氛骤降。老头出来打圆场，让下人带风广陌去休息，明日再举行封印祭礼。风广陌走后，休宁猜测他是贪玩儿才迟到了，老头倒觉得风广陌刚来人间被吸引是人之常情。休宁提出封印祭礼需再找一位稳重之人帮忙，并想到紫胤真人。白衣少年替云溪包扎伤口，云溪问他从何处来，少年说自己是寻医而来，却在此处迷了路，云溪告诉他要绕过山谷走。少年见天色已晚，想到云溪家借宿，云溪告诉他村子不让外人进入，特别是今明两天。休宁让老鹰传信给紫胤真人。云溪带少年找出谷的路，少年问他过了这两日是否就能进村子，云溪告诉他村子从来不会让外人进出，少年若有所思。找到了出谷的小路，少年送他驱逐野兽的炮仗，云溪问他以后是否还会来这里，少年表示办完事自己会来看他，两人分别。云溪从洞里爬回村子，一出洞就被风广陌抓住，风广陌看项链认出他是休宁的儿子，云溪告诉他自己的名字。风广陌大笑，问他私自外出难道不怕休宁教训他，云溪觉得结界稳固不用担心，并猜出风广陌是幽都来的，希望他能替自己隐瞒外出的事。风广陌让他陪自己喝酒聊天。云溪问起幽都的情况，风广陌却感叹人间更好玩，并描述起人间的繁荣景象，云溪听得入神，希望风广陌完成封印后能带自己出去玩儿，风广陌遗憾的说完成封印自己就得回幽都了，并感叹和云溪同病相怜。
晴雪依旧决定离开幽都，等找到云溪和风广陌再回来。红玉叫来陵越，陵越见焚寂煞气涌动，不知是何缘故。红玉问起屠苏受罚之事，告诉陵越屠苏与焚寂一体，让他去告诫屠苏要稳定心神不可动怒，免得被焚寂趁机控制。陵越去找屠苏，见他跪在紫胤闭关的门外，倾诉心中苦闷，不知自己为何执剑。紫胤在门上显露劝诫真言，屠苏茅塞顿开，心中释然。回到居所，陵越给屠苏送来饭菜和新衣，见他闷闷不乐，便劝他和自己一起修仙，屠苏表示一切听他的。陵越要下山除妖，大家在门口送他。陵越交代好一切事宜，然后偷偷交给屠苏一样法宝，并与他耳语，随后离去。芙蕖和二师兄他们都好奇陵越交给屠苏的东西，屠苏展开手心，却是一个铃铛。二师兄想抢，屠苏便摇动铃铛好好戏弄了他们一番。二师兄他们被戏弄后回到房间，心中十分不服气。二师兄决定要利用四年一次的招收新弟子入门，将屠苏赶出天墉城。晴雪来到人间，拿着地图不知如何找到天墉城。这时发现小河边一群手持兵器的武者围着一个弹琴的翩翩公子，这些武者见公子弹琴不止，失去耐心，想要强行带他离去。晴雪见不惯，站出来制止他们。武者们不听劝，执意要动武，欧阳少恭用琴音控制住这些人的行动，将他们引到小河边让他们跳入水里，晴雪见此忍俊不禁。晴雪问那些人为何会被控制，少恭坦言自己其实早就点了迷魂香，所以那些人才会被控制。少恭问晴雪为何独身来到这里，晴雪胡诌蒙骗他，只说自己来找朋友，并要过他烤好的鱼大吃特吃。少恭看到晴雪吃鱼的样子，想起他昔日的恋人，回过神来却发现晴雪将鱼肚子都吃了，满脸黑线。两人互报姓名，晴雪向他打听天墉城，少恭见她执意要去天墉城找朋友，便与她一起去天墉城参加新弟子招收。到了天墉城报名处，却被告知天墉城不收女弟子。晴雪巧言善辩，这时芙蕖出现，晴雪言语上又对她多加吹捧，芙蕖便同意让她报名。晴雪进入天墉城，到处都见不到云溪，这时二师兄前来，说明了最后一项考核的内容，就是去翡翠谷平安渡过一晚，会有人带着他们去，如果顺利出关便是通过考核。二师兄来找屠苏带队，屠苏不愿去，二师兄以紫胤真人的脸面挑衅，屠苏果然同意。屠苏将大家带到翡翠谷，自己就一人枯坐一旁。少恭问晴雪这是不是她要找的人，并上去与屠苏攀谈想要试探一下，谁知屠苏根本不理他，少恭只好灰溜溜回来。
陵端被少恭揭穿私放妖怪之事，对少恭深为愤恨，故意不教他剑术，安排他去做杂役。屠苏看到这一幕后便单独教少恭剑术，两人友谊渐深。被杀死的姑获鸟怨灵不散，附在芙蕖身上，威胁陵端帮自己找屠苏和少恭报仇，被少恭识破，屠苏、晴雪、少恭三人布阵将姑获鸟怨灵净化，救了陵端，陵端却并不领情。某日少恭想要下山祭奠恋人巽芳，不惜违反门规，屠苏劝阻无果，便偷偷带他下山。此时恰有鬼面人闯入剑阁偷焚寂剑，被剑侍红玉发现，敲响了警钟。山下的屠苏听见钟声立刻和少恭赶往剑阁，路上又被一群鬼面人围攻。这时外出除妖的大师兄陵越终于回到昆仑山，与屠苏、少恭一起击退了鬼面人。三人赶到天墉城，发现鬼面人挟持了晴雪。陵越打败鬼面人救下晴雪，晴雪感到鬼面人很像自己失踪多年的大哥，却不敢说破。
幽都婆婆感到焚寂煞气越来越强，来到天墉城要见紫胤真人，正遇上晴雪。陵越对晴雪身份产生怀疑，一番试探后果然发现幽都婆婆和晴雪私下见面，晴雪作为幽都灵女冒充天墉弟子的事情败露，被责令下山。这时鬼面人再次闯入剑阁，打伤了幽都婆婆，下山的事只好暂时搁置。鬼面人被红玉和陵越击败逃走后，山下安陆村突然被妖怪袭击，向天墉城求救。天墉弟子们下山除妖，屠苏被困于妖怪的幻境，看到鬼面人绑架少恭威胁他交出“焚寂”。幻境中的鬼面人砍掉少恭的手臂，屠苏惊怒之下煞气发作，跑回剑阁抢走了焚寂剑。另一边，陵越与晴雪追踪鬼面人的踪迹，忽然看见屠苏养的海东青“阿翔”求救，陵越赶到安陆村，却只看到巨大的九头蛇妖。陵越不敌蛇妖，危机时刻，手持焚寂的屠苏从天而降，斩杀了蛇妖。但被焚寂煞气侵心的屠苏在击败蛇妖后仍停不下杀戮之念，打伤了陵越。紫胤真人及时赶到，封住了煞气。屠苏力竭昏迷，躲在暗处的鬼面人见紫胤出关便悄悄逃走。
屠苏对打伤大师兄的事深感自责，紫胤要求他在禁地闭关三年，面壁思过。晴雪知道了屠苏就是当年的韩云溪，和婆婆回到幽都，努力学习幽都古卷，寻找消除煞气之法。少恭与屠苏告别，打算回到故乡琴川，临走前鼓励他不要屈服于命运。少恭下山后遇到青玉坛坛主雷严，雷严以少恭的老仆人“寂桐”的性命相威胁，要求他加入青玉坛为自己炼药。三年后，芙蕖向天墉城掌教涵素真人求情，将屠苏放出了禁地，此举又惹来暗恋芙蕖的陵端的嫉妒。少恭在青玉坛担任了丹芷长老，雷严派去监视他的婢女素锦对他暗暗钟情，假扮成他的恋人巽芳，令少恭十分震怒，不打算继续留在青玉坛。少恭在青玉坛期间本就不是真心效忠，一直与江湖游侠尹千觞暗中联系，寻找复活巽芳之法。尹千觞带来消息说江都一带可能有线索，少恭立刻与他商量分头行动，带着寂桐离开了青玉坛。
陵端百般挑衅屠苏，屠苏一旦动怒便会煞气侵心，唯有凭坚毅性格默默忍耐。陵越认为不是长久之计，便去幽都询问是否有更好的抑制煞气的方法。屠苏痛苦难耐，试图毁掉焚寂，被红玉阻止。红玉责怪他行事草率，罚他去藏经阁抄写经文。陵端的小跟班肈临也因为乱嚼舌根被罚去藏经阁抄书，刚看到屠苏也在时十分惧怕这个“怪物”，相处一段时间后却觉得屠苏也是个内心温和善良的人。满月之夜，焚寂煞气最强烈的时候，一个鬼面人潜入藏经阁偷焚寂，被肈临发现，鬼面人立刻用焚寂杀死肈临。屠苏夺回焚寂，追踪鬼面人来到树林，虽然以焚寂砍伤了鬼面人的手臂，却还是被他逃脱。回到天墉城时，陵端等人见肇临死去，伤口有焚寂煞气，一致认定是屠苏杀死了肇临。屠苏百口莫辩，冤屈之下煞气发作，与同门大打出手，掌教真人率领众人结阵将他打成重伤，关入牢笼等待处决。芙蕖相信屠苏没有杀人，偷偷将屠苏放走，红玉也相信屠苏，将焚寂交给他，嘱咐他在山下躲避一段时间，等待紫胤真人出关主持公道。屠苏对山下的世界毫无了解，唯一知道的地名便是少恭临走前提到的琴川，便决定去琴川找少恭。
陵越带着晴雪回到天墉城，没有见到屠苏，只听到他杀死肈临逃往山下的消息。陵越相信屠苏不是凶手，让晴雪下山寻人，自己留在城中查访线索。与此同时，少恭与寂桐在路上遇到了石妖，寂桐挡在少恭身前被石妖打伤，少恭击败石妖后发现她们在用玉横碎片修炼。玉横是吸灵的宝物，也正是少恭寻找的复活巽芳的关键。寂桐受伤后不宜奔波，少恭便打算带她回琴川休养。另一边，屠苏在琴川遇到了痴迷修仙的书生方兰生，又因为没钱而留在方家当杂工。兰生缠着屠苏教他仙术，屠苏不答应，兰生偶然间得知屠苏在找少恭，便说自己是少恭小时候的朋友，以少恭的消息作为交换条件要求屠苏教他。屠苏教了几天，发现兰生并没有少恭的消息，而兰生的二姐方如沁也觉得兰生天天跟着屠苏胡闹不成体统，于是如沁辞退了屠苏，屠苏也干脆地答应离开。临走前屠苏捡到兰生不小心掉落的青玉司南佩，被方家家丁当成小偷，一怒之下拂袖而去，煞气发作晕倒在街上。
琴川捕头吴叔救了昏迷的屠苏，为了报答，屠苏便帮他查案。最近琴川正在闹采花贼，屠苏追着贼跑进方家，却被方兰生误当成打算对如沁下手的采花贼。屠苏不欲解释，离开方家后又在河边撞见风晴雪沐浴，兰生更加坚信屠苏是要轻薄晴雪，幸好有吴叔出面解释才消除了误会。为防采花贼再来，屠苏和晴雪入住方家保护如沁。第二天屠苏和晴雪前去调查之前的受害女子，却发现这个采花贼并没轻薄受害女子。而对于他的容貌，受害女子则持极美、极丑两种极端描述，二人心内生疑。采花贼在所有案犯现场均留下一只涂有迷药的兰花。方如沁提到孙家小姐孙月言喜种兰花，但身弱多病极少外出。晴雪以兰花作为礼物，上门求见孙月言。得知事情原委，孙月言决心帮忙。晴雪与月言很快成了好姐妹，屠苏则在追踪可疑人物时遇上了一个叫他“云溪哥哥”的少女——襄铃，但他对这个少女毫无印象。
七夕那天，琴川的年轻人都去月老庙求姻缘，兰生抛出的彩带砸到了月言，但两人都不知道一段天定之缘已经开始。许愿树下，襄铃和晴雪为了争夺香囊打了起来，屠苏追着一个可疑的人到城外发现是调虎离山之计，此时没有人保护的如沁已经被真正的采花贼带走。屠苏和兰生追着马车的痕迹来到山上，意外遇到了少恭。少恭检查出兰花上的迷药来自赤练草，而赤峰山中盛产赤练草，山上正好又有一个山贼的窝点——翻云寨。少恭说服兰生男扮女装，三人假做求医问药者混入翻云寨。见到兰生女装美艳，众匪爽快放他们进了内厅。兰生在寨中果然找到了姐姐如沁，结果被翻云寨寨主、采花贼李潘安发现。兰生谎称自己想说服如沁和李潘安成亲，骗过了李潘安。
兰生说如沁已经答应成亲，李潘安开心地大摆筵席，少恭便趁机在酒水中下药。洞房花烛夜，李潘安揭开新娘的盖头，等待他的却是兰生。早已埋伏在一旁的屠苏将李潘安击败，李潘安想逃，兰生顺手一酒坛把他砸晕，此时寨中众匪也被少恭的药放倒。屠苏将众匪交给如沁发落，如沁饶了众匪一命，望他们改过自新。回到琴川，少恭发现玉横碎片不知何时已经丢失，而此物恰被李潘安拾到，让他觉得炼出新的丹药有望。屠苏向少恭坦言，他被天墉城众人当作杀死肇临的凶手。为防连累众人，屠苏打算偷偷离开，少恭极力挽留，屠苏终于解开心结。
